Si, dans l’hémisphère Sud, le virus grippal a faiblement circulé durant l’hiver austral 2020, probablement en raison des mesures barrières, « les rhinovirus et VRS ont cependant été détectés » et « cela ne présage pas de la dynamique grippale à venir dans l’hémisphère Nord », indique la DGS. Ainsi, la surveillance habituelle de la grippe coordonnée par Santé publique France (SPF) a repris en semaine 40 (du 28 septembre au 4 octobre).
Comme la clinique ne permet pas de différencier le Covid des autres infections hivernales, l'autorité sanitaire a adapté la stratégie diagnostique, notamment de la grippe, sans changer celle du SARS-CoV-2. Pour les personnes sans facteur de risque de forme grave de grippe et de Covid-19, « qu’elles soient symptomatiques ou asymptomatiques, la recherche systématique de la grippe n’est pas indiquée ».
Recherche simultanée de la grippe et du SARS-CoV-2
En revanche, pour les personnes à risque de forme grave de grippe et de Covid-19 et « en cas de circulation de virus grippaux rapportée par SpF », la recherche simultanée des virus grippaux et du SARS-CoV-2 par test moléculaire (RT-PCR) est recommandée.
Pour le nourrisson et l’enfant de moins de 6 ans, devant un tableau typique de bronchiolite ou de gastro-entérite peu sévère, en l’absence de contact avéré de Covid-19 et de facteur de risque de forme grave personnel ou dans l’entourage, « la recherche du SARS-CoV-2 n’est pas indiquée en première intention », est-il écrit.
Chez l'enfant en cas de tableau atypique ou grave
Chez les moins de 6 ans, la DGS précise que la recherche du Covid sur prélèvement nasopharyngé par test moléculaire est indiquée devant un tableau de bronchiolite atypique ou de gastro-entérite atypique sévère ou nécessitant une hospitalisation :
- Et/ou apparu après un contact avéré ou suspecté Covid-19 ;
- Et/ou en présence de facteur de risque personnel ou dans l’entourage ;
- Et/ou hors contexte épidémique de bronchiolite/GEA.
De plus, l'autorité sanitaire indique « qu'un recours aux tests PCR multiplex lorsque disponibles est indiqué pour permettre la recherche d’autres virus et bactéries atypiques, utiles au diagnostic ». Il est rappelé que si le prélèvement nasopharyngé se révèle impossible ou difficile à réaliser chez un patient symptomatique, et notamment un enfant, la RT-PCR détectant le SARS-CoV-2 peut être réalisée sur prélèvement salivaire.
Quant à l’enfant de plus de 6 ans et l’adolescent, « au regard de la moindre fréquence des infections virales hivernales saisonnières », les indications de test Covid-19 peuvent être élargies, comme chez l’adulte, en dehors de contextes épidémiques très évocateurs (épidémie familiale de grippe ou de gastro-entérite par exemple).